我國的中藥材種植質量參差不齊，存在著以下這些問題：

1.種子種苗問題突出

沒有專門的管理部門。我國中藥材種子種苗是按照農作物種子和林木種子來管理的，這與中藥材種子種苗管理的特殊性和專業性不相符合。一是中藥材種子種苗種類繁多，由農作物種子種苗管理部門來管理造成管理效果欠佳；二是大多數中藥材種子種苗由中藥材種植戶在市場直接交易，造成管理困難。

2.種植過程缺乏科化學、規范化管理

截止2012年，我國已經有75個企業按照《中藥材生產質量管理規范（試行）》（GAP）建立了中藥材種植基地。此外，我國絕大多數中藥材種植由農戶完成。但在2013年國際對美國、英國等7個國家的產自中國的中藥材產品進行抽檢時發現，樣品中含有多種農藥殘留，包括同仁堂、云南白藥、胡慶余堂等全國九大中藥品牌，可見我國中藥材種植過程缺乏科學化規范化管理。我國GAP種植基地存在下列問題。

1) 種植基地數量少。中藥材種植具有特殊要求，如氣候、土壤等。

2) 缺乏強制認證。費用極高，最終可能轉嫁大盤消費者身上。

3) 生產達不到標準。管理制度不健全、生產不規范，種植出中藥材不達標。

體現不出優質優價。由于缺乏市場保護政策，目前通過GAP基地種植出的優質中藥材在市場上并沒體現出太多價格優勢。

3.生產帶有盲目性，缺乏全面規劃和市場預測

在市場經濟條件下，藥材種植分散于千家萬戶，由于沒有固定的組織去協調生產計劃，藥農只能憑借某一品種在某一時候、市場所表現出來的商品價格，去判斷是否種植，種植多少，而很少考慮當這種產品面對市場時，市場的需求變化。這樣，往往出現中藥材周期性過剩或短少的波動。這種畸形波動，使得不少名貴道地藥材在市場上很難長久保持其應有的珍貴與身價。

實踐中，一方面藥材企業同中藥材種植戶沒有建立起穩定合同關系，沒有長期穩定的藥源基地；另一方面中藥材農戶被動承擔市場風險，收益極不穩定。長遠來看，不僅沒有經濟效益，對中成藥以及中藥提取物的生產和出口都極為不利。

可以從以下幾個方面采取措施，把好中藥原材料的質量關：

（1）在挑選種子和培育種植過程中就能達到國家甚至國際標準，提高其競爭力；

（2）在與農戶合作過程中，進行監督和規范化管理；

（3）打造品牌效應，品牌意識。當消費者了解到某一道地中藥材時，是否就能立刻聯想到此種藥材的生產園區及道地地域，進而形成品牌優勢，穩穩抓住市場占有額。